說起黑衣組織的臥底，說多了都是淚，只能默默心疼琴酒了。因此也有人調侃，黑衣組織其實不存在的，只是公安們誤以為它存在，因而形成的臥底群？都是臥底，全部都是戲精，相互演戲？
當然這些也都是戲言，黑衣組織中確實存在挺多的臥底，我們這就簡單來說說吧。
赤井秀一（諸星大）
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赤井秀一，是《名偵探柯南》當中人氣比較高的角色了，也是第一個從反派洗成臥底的角色。當初帶給灰原哀和柯南不少的壓力，後來才公布身份，是FBI派出去的臥底，已經脫離組織。是琴酒的眼中釘，一心想要除掉赤井秀一，然而並不能夠成功。目前赤井秀一偽裝成了沖矢昴，住工藤新一家的豪宅中，以便於保護灰原哀。
水無怜奈
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水無怜奈黑衣組織代號基爾，目前屬於風險比較高的人物。水無怜奈並不是其本命，只是在電視台工作時期的化名，被懷疑身份，汽車追逐中遭遇車禍，失憶，被FBI控制。
在一次黑衣組織臥底大清掃過程中，被琴酒懷疑，多虧柯南獻計，赤井秀一獻身得以繼續在黑衣組織中臥底。
降谷零
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代號波本，人氣也比較高，化名安室透，在毛利小五郎家樓下做服務員。推理能力同樣非常出色，車技一流，具有格鬥能力。仇視赤井秀一，因為其夥伴的遭遇。
目前組織中屬於混得比較穩當的，貝爾摩德可能知其身份。
諸伏景光
組織代號蘇格蘭，降谷零摯友，和赤井秀一是同一行動小隊。因為臥底身份暴露，選擇自殺，已經殉職。
其他
還記得那次對臥底的圍剿麼？是非時期，琴酒解決了不少的臥底。至於其他臥底，大概可能還會有的吧。